臺北市萬華區西門國民小學：核定總班級數36班(包括普通班24班、特殊班4班、體育班2班、幼兒園6班)，下設3處3室1幼兒園。

校長: 1.綜理全校業務。2.其他臨時交辦事項。

本校各單位職掌如下：

教務處: 辦理教師專業發展及教學相關業務。

學務處: 辦理學生學習活動、生活體育、健康教育等相關業務。

總務處: 辦理庶務採購、工程招標、出納、財產管理及文書等相關業務。

輔導室: 辦理性別平等、家庭教育及輔導諮商業務。

會計室: 依法辦理歲計、會計及統計等事項。

人事室: 依法辦理人事管理事項。

幼兒園: 辦理幼兒教學及保育相關業務。